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聚丙烯酰胺凝膠電泳溶液的研制與分析

發(fā)布時(shí)間:2019-01-05人氣:105
聚丙烯酰胺凝膠電泳簡(jiǎn)稱為PAGE(Polyacrylamide gel electrophoresis),是以聚丙烯酰胺凝膠作為支持介質(zhì)。它在樣品介質(zhì)和聚丙烯酰胺凝膠中加入離子去污劑和強(qiáng)還原劑后,蛋白質(zhì)亞基的點(diǎn)泳遷移率主要取決于亞及分子量的大小,而電荷因素可以被忽略。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)的分子量在15KD到200KD之間時(shí),電泳遷移率與分子量的對(duì)數(shù)呈線性關(guān)系,可以用來(lái)測(cè)定蛋白質(zhì)亞基的分子量。聚丙烯酰胺凝膠是由單體的丙烯酰胺(CH2=CHCONH2 Acrylamide)和甲叉雙丙烯酰胺(CH2(NHCOHC=CH2) 2 N,N'-methylenebisacrylamide)聚合而成,這一聚合過(guò)程需要有自由基催化完成。常用的催化聚合方法有兩種:化學(xué)聚合和光聚合?;瘜W(xué)聚合通常是加入催化劑過(guò)硫酸銨(AP)以及加速劑四甲基乙二胺(TEMED),四甲基乙二胺催化過(guò)硫酸銨產(chǎn)生自由基:以R·代表自由基,M代表丙烯酰胺單體,這樣由于乙烯基"CH2=CH-"一個(gè)接一個(gè)的聚合作用就形成丙烯酰胺長(zhǎng)鏈,同時(shí)甲叉雙丙烯酰胺在不斷延長(zhǎng)的丙烯酰胺鏈間形成甲叉鍵交聯(lián),從而形成交聯(lián)的三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。氧氣對(duì)自由基有清除作用,所以通常凝膠溶液聚合前要進(jìn)行抽氣。丙烯酰胺的另一種聚合方法是光聚合,催化劑是核黃素,核黃素在光照下能夠產(chǎn)生自由基,催化聚合反應(yīng)。一般光照2-3小時(shí)即可完成聚合反應(yīng)。 聚丙烯酰胺凝膠分離蛋白質(zhì)較初是在玻璃管中進(jìn)行的,玻璃管通常直徑為7 mm,長(zhǎng)10 cm,將凝膠裝入到多個(gè)管中進(jìn)行電泳,又稱為柱狀電泳。目前仍有應(yīng)用,尤其用于二維電泳中的優(yōu)質(zhì) 維電泳。但由于各個(gè)玻璃管的不同以及裝膠時(shí)的差異使每管的分離條件會(huì)有所差異,所以對(duì)各管樣品進(jìn)行比較時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)較大誤差。后來(lái)發(fā)展起來(lái)的垂直平板電泳一次較多可以容納20個(gè)樣品,電泳過(guò)程中樣品所處的條件比較一致,樣品間可以進(jìn)行更好的比較,重復(fù)性也更好,所以垂直平板電泳目前應(yīng)用的更為廣泛,常用于蛋白質(zhì)及DNA序列分析過(guò)程中DNA片段的分離、鑒定。 水平平板電泳近年來(lái)也有很快的發(fā)展,與垂直平板電泳相比也有其獨(dú)特的優(yōu)點(diǎn):①由于凝膠可以直接鋪在冷卻板上,容易使凝膠冷卻,因而可以加高電壓以提高分辨率。②電泳速度快,通常只要1小時(shí)左右,而園盤電泳和垂直平板電泳一般需要3~4小時(shí)。③因?yàn)榭梢允褂帽∧z,加樣少,染色快,從而提高了靈敏度,而且容易保存,只要用甘油浸泡后自然干燥即可長(zhǎng)期保存不會(huì)龜裂。④便于適用各種電泳方式,用途廣泛,尤其是可以使用90年代才發(fā)展起來(lái)的只有水平電泳系統(tǒng)才能使用的新的半干技術(shù),即用浸有少量緩沖液的半干的膠條代替通常所用的大量電很 緩沖液,大大節(jié)約了試劑,簡(jiǎn)化了操作,提高了電泳速度。 聚丙烯酰胺凝膠的孔徑可以通過(guò)改變丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺的濃度來(lái)控制,丙烯酰胺的濃度可以在3%-30%之間。低濃度的凝膠具有較大的孔徑,如3%的聚丙烯酰胺凝膠對(duì)蛋白質(zhì)沒(méi)有明顯的阻礙作用,可用于平板等電聚焦或SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的濃縮膠,也可以用于分離DNA;高濃度凝膠具有較小的孔徑,對(duì)蛋白質(zhì)有分子篩的作用,可以用于根據(jù)蛋白質(zhì)的分子量進(jìn)行分離的電泳中,如10%-20%的凝膠常用于SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的分離膠。聚合后的聚丙烯酰胺凝膠的強(qiáng)度、彈性、透明度、粘度和孔徑大小均取決于兩個(gè)重要參數(shù)T和C,T是丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺兩個(gè)單體的總百分濃度。C是與T有關(guān)的交聯(lián)百分濃度。T與C的計(jì)算公式是: C = 6.5-0.3T 上式中a為丙烯酰胺的克數(shù),b為甲叉雙丙烯酰胺的克數(shù),m為水或緩沖液體積(ml)。式中a與b的比例很重要。富有彈性,且完全透明的凝膠,a與b的重量比應(yīng)在30左右。選擇T和C的經(jīng)驗(yàn)公式是: C = 6.5-0.3T此式可用于計(jì)算T為5%~20%時(shí)的凝膠組成。C值并不很嚴(yán)格,在大多數(shù)情況下,可變化的范圍約為 ±1%,當(dāng)C保持恒定時(shí),凝膠的有效孔徑隨著T的增加而減小,當(dāng)T保持恒定,C為4%時(shí),有效孔徑較小,C大于或小于4%時(shí),有效孔徑均變大,C大于5%時(shí)凝膠變脆,不宜使用,實(shí)驗(yàn)中較常用的C是2.6%和3%。 操作流程: 1.安裝灌膠模具,依照說(shuō)明書進(jìn)行 2.按照配方配置一定量(7cm模具配置1mm厚的膠配置5ml)的分離膠溶液和濃縮膠溶液(2ml),過(guò)硫酸銨和TEMED在用前加入。 3.分離膠溶液充分混勻后從一側(cè)加入灌膠模具,上方留約1.5-2cm用于加濃縮膠,小心的在分離膠的表面加一層水飽和正丁醇(或水飽和的異丙醇、水),封住膠面,以促使聚合并保持膠面平整。 4.室溫放置40分鐘到1小時(shí)后,可以看到一個(gè)界面,去掉上層覆蓋液,用濃縮膠緩沖液淋洗膠面,然后灌制濃縮膠,并插入與模具大小相同,凝膠厚度相當(dāng)?shù)氖嶙印? 5.靜止放置40-60分鐘使凝膠聚合,電泳液清洗樣品孔。 6.制備好的蛋白質(zhì)樣品用2Xloading buffer 1:1混合,與分子量marker 一起100℃煮3-5min, 12000rpm離心5-10min,(7cm模具、1mm厚度、10孔、考染上樣量30ug) 7.加入下槽液,把夾有凝膠的玻板轉(zhuǎn)移到電泳槽,加入上槽液,上樣。 8.連接電源,5-10mA/膠開(kāi)始電泳,待溴酚藍(lán)前沿到達(dá)分離膠后加大電流到10-15mA/膠, 9.溴酚藍(lán)前沿到達(dá)玻璃板底部時(shí)停止電泳,取出凝膠,做好標(biāo)記,準(zhǔn)備染色。 10.染色。見(jiàn)考馬斯亮藍(lán)染色操作規(guī)程及銀染色操作規(guī)程。 11.掃描。掃描操作見(jiàn)掃描儀的使用說(shuō)明。 由于聚丙烯酰胺凝膠有突出的優(yōu)點(diǎn),因而四十年來(lái)得到廣泛的應(yīng)用,目前尚無(wú)更好的支持介質(zhì)能夠取代它。其主要的優(yōu)點(diǎn)有:①可以隨意控制膠濃度"T"和交聯(lián)度"C",從而得到不同的有效孔徑,用于分離不同分子量的生物大分子。②能把分子篩作用和電荷效應(yīng)結(jié)合在同一方法中,達(dá)到更高的靈敏度:10-9 ~10-12 mol/L。③由于聚丙烯酰胺凝膠是由-C-C-鍵結(jié)合的酰胺多聚物,側(cè)鏈只有不活潑的酰胺基-CO-NH2 ,沒(méi)有帶電的其他離子基團(tuán),化學(xué)惰性好,電泳時(shí)不會(huì)產(chǎn)生"電滲"。④由于可以制得高純度的單體原料,因而電泳分離的重復(fù)性好。⑤透明度好,便于照相和復(fù)印。機(jī)械強(qiáng)度好,有彈性,不易碎,便于操作和保存。⑥無(wú)紫外吸收,不染色就可以用于紫外波長(zhǎng)的凝膠掃描作定量分析。⑦還可以用作固定化酶的惰性載體。 注意事項(xiàng) 1.在加過(guò)硫酸銨和TEMED之前溶液較好抽氣,防止溶解在溶液里的分子氧在聚合時(shí)產(chǎn)生氣泡使膠不均一。 2.過(guò)硫酸銨和TEMED的量應(yīng)根據(jù)室溫和聚合情況而定。 3.分離膠聚合后較好在4℃放置12小時(shí)后再使用,以使凝膠充分聚合,改善電泳時(shí)的分辨率。 4.為防止氣泡陷入,梳子應(yīng)傾斜插入。 5.如果帶著梳子過(guò)夜可能會(huì)影響分辨率,所以濃縮膠較好在使用前再灌制。 6.如果沒(méi)有足夠數(shù)目的樣品,應(yīng)在加樣孔中加樣品緩沖液,不要留有空孔,以防止電泳時(shí)鄰近的帶擴(kuò)展。 7.對(duì)樣品濃度不確定的情況下,加樣時(shí)使用梯度加樣法,能大致估計(jì)出樣品的濃度。 配成30%的丙烯酰胺水溶液在4℃下能保存1個(gè)月,在貯存期間丙烯酰胺會(huì)水解為丙烯酸而增加電泳時(shí)的電內(nèi)滲現(xiàn)象并減慢電泳的遷移率。丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺是一種對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)有毒的試劑,操作時(shí)要避免直接接觸皮膚,但它們聚合后則無(wú)毒。 未加SDS的天然聚丙烯酰胺凝膠電泳可以使生物大分子在電泳過(guò)程中保持其天然的形狀和電荷,它們的分離是依據(jù)其電泳遷移率的不同和凝膠的分子篩作用,因而可以得到較高的分辨率,尤其是在電泳分離后仍能保持蛋白質(zhì)和酶等生物大分子的生物活性,對(duì)于生物大分子的鑒定有重要意義,其方法是在凝膠上進(jìn)行兩份相同樣品的電泳,電泳后將凝膠切成兩半,一半用于活性染色,對(duì)某個(gè)特定的生物大分子進(jìn)行鑒定,另一半用于所有樣品的染色,以分析樣品中各種生物大分子的種類和含量。 更多聚丙烯酰胺相關(guān)信息,請(qǐng)登錄http://www.odmcc.cn佰科聚丙烯酰胺官方網(wǎng)站  

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